Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtprdQ64487 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtprdQ64487 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtprdQ64487 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprdQ64487 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PtprdQ64487 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PtprdQ64487 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PtprdQ64487 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PtprdQ64487 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PtprdQ64487 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PtprdQ64487 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PtprdQ64487 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PtprdQ64487 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PtprdQ64487 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PtprdQ64487 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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