Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim24Q64127 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim24Q64127 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trim24Q64127 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trim24Q64127 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trim24Q64127 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim24Q64127 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms