Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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