Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Polr2kQ63871 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms