Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms