Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ss18Q62280 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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