Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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Sall3Q62255 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Sall3Q62255 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Sall3Q62255 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Sall3Q62255 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Sall3Q62255 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Sall3Q62255 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Sall3Q62255 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Sall3Q62255 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Sall3Q62255 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Sall3Q62255 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Sall3Q62255 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sall3Q62255 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms