Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms