Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox17Q61473 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms