Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PcolceQ61398 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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PcolceQ61398 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PcolceQ61398 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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