Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms