Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot7Q60809 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cnot7Q60809 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cnot7Q60809 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cnot7Q60809 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms