Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P4ha1Q60715 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha1Q60715 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms