Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Foxd4Q60688 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Foxd4Q60688 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Foxd4Q60688 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Foxd4Q60688 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Foxd4Q60688 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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