Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

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Length 764 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Satb1Q60611 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Satb1Q60611 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Satb1Q60611 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Satb1Q60611 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Satb1Q60611 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Satb1Q60611 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Satb1Q60611 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Satb1Q60611 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Satb1Q60611 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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