Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynrgQ5SV85 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms