Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psme4Q5SSW2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms