Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms