Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3kQ5GIG6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3kQ5GIG6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms