Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f8Q58FA4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f8Q58FA4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms