Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Krtap9-3Q3V2C1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms