Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms