Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms