Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trim80Q3V061 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim80Q3V061 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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