Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms