Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms