Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm6899Q3USS0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm6899Q3USS0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm6899Q3USS0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm6899Q3USS0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm6899Q3USS0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm6899Q3USS0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm6899Q3USS0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm6899Q3USS0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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