Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms