Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms