Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms