Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms