Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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