Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E330014E10RikQ3UL33 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms