Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpr55Q3UJF0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms