Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms