Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms