Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Q3U6N9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Q3U6N9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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