Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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