Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LcorlQ3U285 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms