Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms