Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Srsf6Q3TWW8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Srsf6Q3TWW8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Srsf6Q3TWW8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms