Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms