Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp39Q3TIX9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp39Q3TIX9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp39Q3TIX9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp39Q3TIX9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp39Q3TIX9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp39Q3TIX9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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