Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam107bQ3TGF2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam107bQ3TGF2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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