Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RubcnlQ3TD16 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RubcnlQ3TD16 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RubcnlQ3TD16 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RubcnlQ3TD16 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RubcnlQ3TD16 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RubcnlQ3TD16 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RubcnlQ3TD16 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RubcnlQ3TD16 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RubcnlQ3TD16 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RubcnlQ3TD16 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms