Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms