Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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ptchd1Q14B62 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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ptchd1Q14B62 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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ptchd1Q14B62 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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