Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Perm1Q149B8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Perm1Q149B8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Perm1Q149B8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Perm1Q149B8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Perm1Q149B8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Perm1Q149B8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Perm1Q149B8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Perm1Q149B8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Perm1Q149B8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Perm1Q149B8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Perm1Q149B8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Perm1Q149B8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Perm1Q149B8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Perm1Q149B8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Perm1Q149B8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Perm1Q149B8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Perm1Q149B8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Perm1Q149B8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms