Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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