Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms